3D Slicer(通常简称 Slicer)是一款专门用于医学图像信息学、图像处理和三维可视化的软件平台。

核心特点

  1. 跨平台:完美支持 macOS(包括 Apple Silicon 芯片)、Windows 和 Linux。

  2. 模块化设计:其功能由一个个“模块”提供,用户可以根据自己的需求加载不同的功能扩展,这使得软件既灵活又不臃肿。

  3. 强大的社区支持:由全球的研究人员、工程师和医生共同开发和维护,拥有活跃的社区和丰富的文档。

  4. 专注于研究:它主要是一个研究平台,而非通过 FDA 认证的临床工具。这意味着它功能前沿、灵活,但不能直接用于指导患者的诊断和治疗。


主要功能和用途

3D Slicer 的功能极其丰富,以下是一些最常用的核心功能:

1. 医学图像可视化和三维重建

  • 多平面重建:可以同时浏览图像的横断面、冠状面和矢状面。

  • 三维体渲染:将CT、MRI等数据直接渲染成具有半透明效果的三维图像。

  • 模型生成:可以从图像数据中(通过分割)提取出特定器官、组织或肿瘤的三维表面模型,用于手术规划、解剖学教育等。

    • 应用示例:从头部CT数据中重建出头骨和血管的三维模型。

2. 图像分割

这是Slicer的强项,即从图像中分离出感兴趣的区域。

  • 多种分割工具:提供阈值分割、区域生长、水平集、人工智能辅助分割等多种工具。

  • 分割编辑器:允许用户对自动分割的结果进行精细的手动修改。

3. 图像配准

将不同时间、不同模态或不同病人获得的图像进行空间对齐。

  • 应用示例:将术前的MRI图像与术中的CT图像进行配准,以指导手术导航;或将同一病人在治疗前后的CT图像进行配准,以评估治疗效果。

4. 定量分析

对分割出的结构进行精确测量。

  • 测量体积、表面积、尺寸:例如,测量肿瘤的体积变化来评估化疗效果。

  • 图像灰度值分析:分析特定区域的密度或信号强度。

5. 扩展模块功能

通过安装扩展,可以无限扩展Slicer的能力:

  • SlicerRT:用于放射治疗计划。

  • MonaiAI:集成人工智能模型,用于自动分割和诊断。

  • SlicerIGT:用于图像引导治疗。

  • 许多其他专业领域的扩展,如骨科、心脏、神经科学等。

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