Cellprofiler for mac v4.2.5 生物细胞学分析软件 激活版

CellProfiler 是一款专门为生物学家设计的软件，用于自动量化大批量细胞图像。它可以识别图像中的细胞、细胞核、克隆等物体，并测量其数量、大小、形状、荧光强度等数百个特征。

核心特点

1. 无需编程：主要通过直观的图形化“管道”来构建分析流程，用户通过拖放模块即可完成复杂的图像分析，对生物学家非常友好。

2. 跨平台：完美支持 macOS、Windows 和 Linux。

3. 高通量分析：专为处理由高通量显微镜产生的数百甚至数千张图像而设计，可以批量处理数据。

4. 强大的社区和预设流程：拥有活跃的用户社区，并提供了许多针对常见实验（如细胞计数、共定位分析等）的预置分析流程。

主要功能和用途

CellProfiler 的核心是构建一个 “管道”，这个管道由一系列按顺序执行的模块组成。

1. 图像预处理

在分析前对图像进行优化，以提高分析的准确性。

• 颜色与照明校正：消除图像间因拍摄时间或条件不同造成的照明不均。

• 图像增强：如去噪、锐化等。

2. 物体识别

这是最关键的一步，将图像中的目标“找出来”。

• 识别细胞核：通常使用较亮的染料（如DAPI）。

• 识别整个细胞：可以通过细胞质染料或膜染料。

• 识别其他物体：如菌落、斑马鱼、组织区域等。

3. 测量与量化

在识别出物体后，对其进行量化测量。

• 形态测量：面积、周长、长宽比、偏心度等。

• 强度测量：每个物体内荧光标记的平均强度、最大强度、总强度等。这是分析蛋白表达量的关键。

• 纹理测量：描述物体内部的图案。

• 位置关系测量：测量两个物体之间的距离，例如分析蛋白质的共定位。

4. 数据导出

将测量结果导出为标准格式，以便进行后续统计分析和绘图。

• 导出到 Excel 或 CSV 文件：每个识别出的物体都是一行数据，每一列是一个测量特征。

• 导出图像：将分析结果（如物体轮廓）叠加在原图上，用于验证分析的准确性。

•